Bên cạnh những nâng cấp trên, Yamaha R3 vẫn được sử dụng hệ thống động cơ giống như trên phiên bản trước. R3 2017 sử dụng hệ thống động cơ 2 xi-lanh dung tích 321 phân khối, DOHC, làm mát bằng chất lỏng, phun xăng điện tử. Hệ thống động cơ này giúp sản sinh công suất 41,5 mã lực tại 10.750 vòng/phút, mô-men xoắn cực đại 29,6 Nm tại 9.000 vòng/phút, đi kèm hộp số 6 cấp.
Yamaha R3 2017 có chiều dài 2.090mm, rộng 718mm, cao 1.135mm và chiều cao yên 780mm. Xe sử dụng hệ thống phanh loại đĩa đơn, đường kính 298 mm (trước) và đĩa đơn đường kính 220 mm (sau), la-zăng đúc 17inch, lốp trước 110/70, lốp sau 140/70. Trong khi đó thiết kế tổng thể của Yamaha R3 2017 vẫn mang những nét đặc trưng của dòng R.
Tại thị trường Mỹ, phiên bản R3 2017 tiêu chuẩn có giá bán 5.000 USD và phiên bản R3 2017 trang bị hệ thống phanh ABS có giá 5.300 USD.
Tại thị trường Việt Nam, làn sóng “chơi” xe thể thao cỡ nhỏ đã đang không ngừng lớn mạnh. Sở hữu một chiếc sportbike cỡ nhỏ là ước muốn thoả niềm đam mê của những tay yêu tốc độ bắt đầu bước vào cuộc chơi phân khối lớn. Những đối thủ cạnh tranh “đáng gờm” của Yamaha R3 phải kể đến Kawasaki Ninja 300, KTM RC390 hay Benelli BN302.
Vào tháng 9 năm 2015, Yamaha đã lần đầu tiên cho ra mắt khách hàng tại thị trường Việt mẫu Sportbike Yamaha R3 với giá bán tại thời điểm đó là 150 triệu đồng.